@conference{
author = "Gašić, Katarina and Zlatković, Nevena and Kuzmanović, Slobodan and Kuzmanović, Nemanja",
year = "2022",
abstract = "Bakteriozni rak predstavlja ekonomski veoma značajno i široko rasprostranjeno
oboljenje voćaka, vinove loze i pojedinih ukrasnih biljaka. Bolest prouzrokuju tumorogeni
pripadnici familije Rhizobiaceae, posebno rodova Agrobacterium, Allorhizobium i Rhizobium.
Tokom prethodnih proučavanja ove bolesti na biljkama bestrne kupine, kao prouzrokovač
bakterioznog raka identifikovana je nova vrsta iz roda Rhizobium, nazvana Rhizobium
tumorigenes. Međutim, poznato je da tumore ne naseljavaju samo patogene tumorogene
bakterije, već kompleksna zajednica mikroorganizama, sastavljena od različitih vrsta
bakterija. Cilj istraživanja bio je da se prouči raznovrsnost populacije bakterija koja naseljava
tumore na biljkama kupine.
Tokom 2021. godine, na području Lučana, prikupljeno je devet uzoraka kupine sa
simptomima bakterioznog raka. Identifikacija bakterija koje čine mikrobiom bakterioznog
tumora, vršena je primenom metode sekvenciranja nove generacije (NGS). Ukupna DNK
izolovana je iz tkiva tumora, nakon čega je urađeno umnožavanje a zatim sekvenciranje
produkta 16S rRNK gena. Dobijene varijante umnoženih sekvenci (ASV) taksonomski su
determinisane primenom „blastn“ programa.
Rezultati bioinformatičkih analiza pokazali su da je vrsta R. tumorigenes prisutna u
svim testiranim uzorcima sa relativnom zastupljenošću od 14 - 95%. Takođe, ova vrsta bila je
dominantna u pet testiranih uzoraka (42 - 95%). U preostala četiri uzorka, najveću
zastupljenost imale su vrste roda Rachnella (24 - 63%), dok je kod prethodnih pet uzoraka taj
udeo bio znatno niži (0,4 - 9%). U pojedinim uzorcima, detektovano je prisustvo Bacillus sp. (6
- 25%), Rhizobium spp. (8 - 20%), Pectobacteriaceae (~13%), Pantoea sp. (~11%),
Novosphingobium sp. (~7%) i/ili Burkholderiaceae (~5%). Preostale vrste bakterija koje su
dektovane u pojedinim uzorcima, imale su relativnu zastupljenost manju od 5%.
Pored vrste R. tumorigenes, koja je bila prisutna u svim uzorcima tumora kupine, a
koja je i u prethodnim istraživanjima identifikovana kao prouzrokovač bolesti, ostale
detektovane vrste takođe mogu ostvariti različite odnose sa biljkom domaćinom. Prema
literaturnim podacima, neke od njih mogu imati ulogu u biološkoj kontroli i/ili kao stimulatori
rasta biljaka.",
publisher = "Društvo za zaštitu bilja Srbije",
journal = "XVII SAVETOVANJE O ZAŠTITI BILJA, Zlatibor, 28. novembar - 1. decembar 2022. godine",
title = "PROUČAVANJE MIKROBIOTE U TUMORIMA POVEZANIM SA BAKTERIOZNIM RAKOM KUPINE",
pages = "49"
}