Frequency and molecular characterization of watermelon mosaic virus from Serbia
Аутори
Vučurović, AnaBulajić, Aleksandra
Stanković, Ivana
Ristić, Danijela
Berenji, Janoš
Krstić, Branka
Чланак у часопису (Објављена верзија)
Метаподаци
Приказ свих података о документуАпстракт
Virus mozaika lubenice (Watermelon mosaic virus, WMV) široko je rasprostranjen u usevima vrežastih kultura, mada se najčešće javlja na Mediteranu i regionima sa umerenom klimom. U Srbiji, WMV je detektovan u pojedinačnim i mešanim infekcijama sa virusom žutog mozaika cukinija (Zucchini yellow mosaic virus, ZYMV) i virusom mozaika krastavca (Cucumber mosaic virus, CMV) u usevima tikava i bundeva gajenim na otvorenom polju. Od virusa tikava, WMV je često prevalentan virus, kako po broju lokaliteta u kojima je dokazan, tako i po učestalosti u samom usevu. Iz ukupno 12 komercijalnih useva na osam lokaliteta, 2009. godine sakupljeno je 583 biljaka Cucurbita pepo cvs. Olinka, Beogradska tikvica i Tosca (cukini forma), kao i C. maxima i C. moschata, sa simptomima virusnih zaraza, koje su analizirane na prisustvo šest najznačajnijih virusa tikava primenom DAS-ELISA metode. WMV je detektovan na manjem broju lokaliteta i u manjoj učestalosti u poređenju sa prethodne dve vegetacije. U pojedinačni...m infekcijama, WMV je detektovan u 11% testiranih biljaka u tri useva, a u mešanim sa ZYMV u 9,9% testiranih biljaka u pet useva i sa CMV u 0,2% testiranih biljaka u jednom usevu. Deo gena za protein omotača virusa i deo 3' neprepisujućeg regiona dva odabrana izolata WMV poreklom iz različitih lokaliteta i biljaka domaćina umnožen je primenom RT-PCR metode, sekvencioniran i upoređen sa sekvencama dostupnim u GenBank bazi podataka. Dobijen je PCR produkt očekivane veličine od 1017 bp. Sekvence izolata 137-08 (Acc. No. GQ259958) i 159-08 (GU144020) pokazale su 94-99% nukleotidne identičnosti sa izolatima WMV iz drugih delova sveta. Sekvence ova dva izolata razlikovala su se jedna od druge samo u dva nukleotidna mesta što nije imalo za posledicu aminokiselinske supstitucije. Filogenetske analize 57 izolata, na osnovu 750 bp sekvence gena za protein omotača, nisu ukazale na korelaciju sa geografskim poreklom izolata, a pokazala su grupisanje izolata u tri molekularne grupe sojeva. Izolati WMV iz Srbije pripadaju grupi I, grupi koja obuhvata najrasprostranjenije izolate ovog virusa u svetu.
Кључне речи:
tikve / virus mozaika lubenice / molekularna identifikacija / genetički diverzitet / filogenetska analizaИзвор:
Pesticides and Phytomedicine/Pesticidi i fitomedicina, 2010, 25, 3, 213-230Издавач:
- Institute of Pesticides and Environmental Protection, Belgrade & Plant Protection Society of Serbia, Belgrade
Финансирање / пројекти:
- Министарство науке, технолошког развоја и иновација Републике Србије, институционално финансирање - 200089 (Универзитет у Новом Саду, Академија уметности) (RS-MESTD-inst-2020-200089)
Институција/група
IZBISTY - JOUR AU - Vučurović, Ana AU - Bulajić, Aleksandra AU - Stanković, Ivana AU - Ristić, Danijela AU - Berenji, Janoš AU - Krstić, Branka PY - 2010 UR - https://plantarum.izbis.bg.ac.rs/handle/123456789/1122 AB - Virus mozaika lubenice (Watermelon mosaic virus, WMV) široko je rasprostranjen u usevima vrežastih kultura, mada se najčešće javlja na Mediteranu i regionima sa umerenom klimom. U Srbiji, WMV je detektovan u pojedinačnim i mešanim infekcijama sa virusom žutog mozaika cukinija (Zucchini yellow mosaic virus, ZYMV) i virusom mozaika krastavca (Cucumber mosaic virus, CMV) u usevima tikava i bundeva gajenim na otvorenom polju. Od virusa tikava, WMV je često prevalentan virus, kako po broju lokaliteta u kojima je dokazan, tako i po učestalosti u samom usevu. Iz ukupno 12 komercijalnih useva na osam lokaliteta, 2009. godine sakupljeno je 583 biljaka Cucurbita pepo cvs. Olinka, Beogradska tikvica i Tosca (cukini forma), kao i C. maxima i C. moschata, sa simptomima virusnih zaraza, koje su analizirane na prisustvo šest najznačajnijih virusa tikava primenom DAS-ELISA metode. WMV je detektovan na manjem broju lokaliteta i u manjoj učestalosti u poređenju sa prethodne dve vegetacije. U pojedinačnim infekcijama, WMV je detektovan u 11% testiranih biljaka u tri useva, a u mešanim sa ZYMV u 9,9% testiranih biljaka u pet useva i sa CMV u 0,2% testiranih biljaka u jednom usevu. Deo gena za protein omotača virusa i deo 3' neprepisujućeg regiona dva odabrana izolata WMV poreklom iz različitih lokaliteta i biljaka domaćina umnožen je primenom RT-PCR metode, sekvencioniran i upoređen sa sekvencama dostupnim u GenBank bazi podataka. Dobijen je PCR produkt očekivane veličine od 1017 bp. Sekvence izolata 137-08 (Acc. No. GQ259958) i 159-08 (GU144020) pokazale su 94-99% nukleotidne identičnosti sa izolatima WMV iz drugih delova sveta. Sekvence ova dva izolata razlikovala su se jedna od druge samo u dva nukleotidna mesta što nije imalo za posledicu aminokiselinske supstitucije. Filogenetske analize 57 izolata, na osnovu 750 bp sekvence gena za protein omotača, nisu ukazale na korelaciju sa geografskim poreklom izolata, a pokazala su grupisanje izolata u tri molekularne grupe sojeva. Izolati WMV iz Srbije pripadaju grupi I, grupi koja obuhvata najrasprostranjenije izolate ovog virusa u svetu. PB - Institute of Pesticides and Environmental Protection, Belgrade & Plant Protection Society of Serbia, Belgrade T2 - Pesticides and Phytomedicine/Pesticidi i fitomedicina T1 - Frequency and molecular characterization of watermelon mosaic virus from Serbia EP - 230 IS - 3 SP - 213 VL - 25 DO - 10.2298/PIF1003213V ER -
@article{ author = "Vučurović, Ana and Bulajić, Aleksandra and Stanković, Ivana and Ristić, Danijela and Berenji, Janoš and Krstić, Branka", year = "2010", abstract = "Virus mozaika lubenice (Watermelon mosaic virus, WMV) široko je rasprostranjen u usevima vrežastih kultura, mada se najčešće javlja na Mediteranu i regionima sa umerenom klimom. U Srbiji, WMV je detektovan u pojedinačnim i mešanim infekcijama sa virusom žutog mozaika cukinija (Zucchini yellow mosaic virus, ZYMV) i virusom mozaika krastavca (Cucumber mosaic virus, CMV) u usevima tikava i bundeva gajenim na otvorenom polju. Od virusa tikava, WMV je često prevalentan virus, kako po broju lokaliteta u kojima je dokazan, tako i po učestalosti u samom usevu. Iz ukupno 12 komercijalnih useva na osam lokaliteta, 2009. godine sakupljeno je 583 biljaka Cucurbita pepo cvs. Olinka, Beogradska tikvica i Tosca (cukini forma), kao i C. maxima i C. moschata, sa simptomima virusnih zaraza, koje su analizirane na prisustvo šest najznačajnijih virusa tikava primenom DAS-ELISA metode. WMV je detektovan na manjem broju lokaliteta i u manjoj učestalosti u poređenju sa prethodne dve vegetacije. U pojedinačnim infekcijama, WMV je detektovan u 11% testiranih biljaka u tri useva, a u mešanim sa ZYMV u 9,9% testiranih biljaka u pet useva i sa CMV u 0,2% testiranih biljaka u jednom usevu. Deo gena za protein omotača virusa i deo 3' neprepisujućeg regiona dva odabrana izolata WMV poreklom iz različitih lokaliteta i biljaka domaćina umnožen je primenom RT-PCR metode, sekvencioniran i upoređen sa sekvencama dostupnim u GenBank bazi podataka. Dobijen je PCR produkt očekivane veličine od 1017 bp. Sekvence izolata 137-08 (Acc. No. GQ259958) i 159-08 (GU144020) pokazale su 94-99% nukleotidne identičnosti sa izolatima WMV iz drugih delova sveta. Sekvence ova dva izolata razlikovala su se jedna od druge samo u dva nukleotidna mesta što nije imalo za posledicu aminokiselinske supstitucije. Filogenetske analize 57 izolata, na osnovu 750 bp sekvence gena za protein omotača, nisu ukazale na korelaciju sa geografskim poreklom izolata, a pokazala su grupisanje izolata u tri molekularne grupe sojeva. Izolati WMV iz Srbije pripadaju grupi I, grupi koja obuhvata najrasprostranjenije izolate ovog virusa u svetu.", publisher = "Institute of Pesticides and Environmental Protection, Belgrade & Plant Protection Society of Serbia, Belgrade", journal = "Pesticides and Phytomedicine/Pesticidi i fitomedicina", title = "Frequency and molecular characterization of watermelon mosaic virus from Serbia", pages = "230-213", number = "3", volume = "25", doi = "10.2298/PIF1003213V" }
Vučurović, A., Bulajić, A., Stanković, I., Ristić, D., Berenji, J.,& Krstić, B.. (2010). Frequency and molecular characterization of watermelon mosaic virus from Serbia. in Pesticides and Phytomedicine/Pesticidi i fitomedicina Institute of Pesticides and Environmental Protection, Belgrade & Plant Protection Society of Serbia, Belgrade., 25(3), 213-230. https://doi.org/10.2298/PIF1003213V
Vučurović A, Bulajić A, Stanković I, Ristić D, Berenji J, Krstić B. Frequency and molecular characterization of watermelon mosaic virus from Serbia. in Pesticides and Phytomedicine/Pesticidi i fitomedicina. 2010;25(3):213-230. doi:10.2298/PIF1003213V .
Vučurović, Ana, Bulajić, Aleksandra, Stanković, Ivana, Ristić, Danijela, Berenji, Janoš, Krstić, Branka, "Frequency and molecular characterization of watermelon mosaic virus from Serbia" in Pesticides and Phytomedicine/Pesticidi i fitomedicina, 25, no. 3 (2010):213-230, https://doi.org/10.2298/PIF1003213V . .