TY  - JOUR
AU  - Ivanović, Milan
AU  - Prokić, Anđelka
AU  - Gašić, Katarina
AU  - Menković, Jelena
AU  - Kuzmanović, Nemanja
AU  - Zlatković, Nevena
AU  - Obradović, Aleksa
PY  - 2023
UR  - https://plantarum.izbis.bg.ac.rs/handle/123456789/715
AB  - During May 2016, severe blight symptoms were observed in several raspberry and blackberry fields in Serbia. In total, 22 strains were isolated: 16 from symptomatic raspberry shoots, 2 from asymptomatic raspberry leaves, and 4 from symptomatic blackberry shoots. Additionally, eight raspberry strains, isolated earlier from two similar outbreaks, were included in the study. Pathogenicity of the strains was confirmed on detached raspberry and blackberry shoots by reproducing the symptoms of natural infection. The strains were Gram-negative, fluorescent on King’s medium B, ice nucleation positive, and utilized glucose oxidatively. All strains were levan positive, oxidase negative, nonpectolytic, arginine dihydrolase negative, and induced hypersensitivity in tobacco leaves (LOPAT + −−− +, Pseudomonas group Ia). Furthermore, all strains liquefied gelatin and hydrolyzed aesculin but did not show tyrosinase activity or utilize tartrate (GATTa + + − −). Tentative identification using morphology, LOPAT, GATTa, and ice-nucleating ability tests suggested that isolated strains belong to Pseudomonas syringae. The syrB gene associated with syringomycin production was detected in all strains. DNA fingerprints with REP, ERIC, and BOX primers generated identical profiles for 29 strains, except for strain KBI 222, which showed a unique genomic fingerprint. In all, 9 of 10 selected strains exhibited identical sequences of four housekeeping genes: gyrB, rpoD, gapA, and gltA. Five nucleotide polymorphisms were found in strain KBI 222 at the rpoD gene locus only. In the phylogenetic tree based on a concatenated sequence of all four housekeeping genes, strains clustered within phylogroup 2 (i.e., genomospecies 1) of the P. syringae species complex, with pathotype strains of P. syringae pv. aceris and P. syringae pv. solidagae as their closest relatives. There was no correlation between genotype and geographic origin, particular outbreak, host, or cultivar.
PB  - APS Publications
T2  - PLANT DISEASE
T1  - Characterization of Pseudomonas syringae Strains Associated with Shoot Blight of Raspberry and Blackberry in Serbia
IS  - 3
VL  - 107
DO  - 10.1094/PDIS-06-22-1425-RE
ER  - 

@article{
author = "Ivanović, Milan and Prokić, Anđelka and Gašić, Katarina and Menković, Jelena and Kuzmanović, Nemanja and Zlatković, Nevena and Obradović, Aleksa",
year = "2023",
abstract = "During May 2016, severe blight symptoms were observed in several raspberry and blackberry fields in Serbia. In total, 22 strains were isolated: 16 from symptomatic raspberry shoots, 2 from asymptomatic raspberry leaves, and 4 from symptomatic blackberry shoots. Additionally, eight raspberry strains, isolated earlier from two similar outbreaks, were included in the study. Pathogenicity of the strains was confirmed on detached raspberry and blackberry shoots by reproducing the symptoms of natural infection. The strains were Gram-negative, fluorescent on King’s medium B, ice nucleation positive, and utilized glucose oxidatively. All strains were levan positive, oxidase negative, nonpectolytic, arginine dihydrolase negative, and induced hypersensitivity in tobacco leaves (LOPAT + −−− +, Pseudomonas group Ia). Furthermore, all strains liquefied gelatin and hydrolyzed aesculin but did not show tyrosinase activity or utilize tartrate (GATTa + + − −). Tentative identification using morphology, LOPAT, GATTa, and ice-nucleating ability tests suggested that isolated strains belong to Pseudomonas syringae. The syrB gene associated with syringomycin production was detected in all strains. DNA fingerprints with REP, ERIC, and BOX primers generated identical profiles for 29 strains, except for strain KBI 222, which showed a unique genomic fingerprint. In all, 9 of 10 selected strains exhibited identical sequences of four housekeeping genes: gyrB, rpoD, gapA, and gltA. Five nucleotide polymorphisms were found in strain KBI 222 at the rpoD gene locus only. In the phylogenetic tree based on a concatenated sequence of all four housekeeping genes, strains clustered within phylogroup 2 (i.e., genomospecies 1) of the P. syringae species complex, with pathotype strains of P. syringae pv. aceris and P. syringae pv. solidagae as their closest relatives. There was no correlation between genotype and geographic origin, particular outbreak, host, or cultivar.",
publisher = "APS Publications",
journal = "PLANT DISEASE",
title = "Characterization of Pseudomonas syringae Strains Associated with Shoot Blight of Raspberry and Blackberry in Serbia",
number = "3",
volume = "107",
doi = "10.1094/PDIS-06-22-1425-RE"
}

Ivanović, M., Prokić, A., Gašić, K., Menković, J., Kuzmanović, N., Zlatković, N.,& Obradović, A.. (2023). Characterization of Pseudomonas syringae Strains Associated with Shoot Blight of Raspberry and Blackberry in Serbia. in PLANT DISEASE
APS Publications., 107(3).
https://doi.org/10.1094/PDIS-06-22-1425-RE

Ivanović M, Prokić A, Gašić K, Menković J, Kuzmanović N, Zlatković N, Obradović A. Characterization of Pseudomonas syringae Strains Associated with Shoot Blight of Raspberry and Blackberry in Serbia. in PLANT DISEASE. 2023;107(3).
doi:10.1094/PDIS-06-22-1425-RE .

Ivanović, Milan, Prokić, Anđelka, Gašić, Katarina, Menković, Jelena, Kuzmanović, Nemanja, Zlatković, Nevena, Obradović, Aleksa, "Characterization of Pseudomonas syringae Strains Associated with Shoot Blight of Raspberry and Blackberry in Serbia" in PLANT DISEASE, 107, no. 3 (2023),
https://doi.org/10.1094/PDIS-06-22-1425-RE . .

TY  - CONF
AU  - Obradović, Aleksa
AU  - Menković, Jelena
AU  - Prokić, Anđelka
AU  - Ivanović, Milan
AU  - Zlatković, Nevena
AU  - Gašić, Katarina
PY  - 2021
UR  - https://plantarum.izbis.bg.ac.rs/handle/123456789/1282
AB  - Glavni cilj istraživanja fitopatogenih bakterija je njihovo bolje poznavanje i razvoj
efikasne strategije zaštite. Klimatske promene, globalna distribucija reproduktivnog biljnog
materijala, evolucija poljoprivredne prakse i povećana zabrinutost za životnu sredinu,
zahtevaju nove pristupe kontroli bakterioza biljaka. Stoga je mogućnost primene prirodnih,
zdravstveno i ekološki prihvatljivih mehanizama kontrole fitopatogenih bakterija, izazvala
povećano interesovanje biljnih bakteriologa. Biološka kontrola, kao novi oslonac integrisanih
strategija kontrole biljnih bolesti, mogla bi doprineti prihvatljivoj efikasnosti i održivosti
trenutnih mera zaštite. Strategije biološke kontrole se uglavnom zasnivaju na sprečavanjju
nastanka infekcije, smanjenju učestalosti bakterioza biljaka bilo selektovanom ili
indukovanom otpornošću, konkurencijom, antibiozom ili ometanjem životnog ciklusa
patogena. Većina poznatih bioloških agenasa pripada rodovima Bacillus, Lactobacillus,
Erwinia, Pantoea, Streptomyces, Bdellovibrio, fluorescentnim Pseudomonas spp.,
bakteriofagima i protozoama. Neki takođe uključuju avirulentne oblike patogenih sojeva. Kao
jedna od ciljanih tačaka, osim samih bakterijskih ćelija, nameće se ometanje formiranja
biofilma ili manipulacija fizioloških procesa bakterije upotrebom signalnih molekula. Novija
istraživanja takođe ukazuju da bi se značajan napredak u ispoljavanju konkurentnosti i
sposobnosti bioloških agensa u proizvodnji antimikrobnih metabolita ili izazivanju otpornosti
biljaka mogao postići boljim razumevanjem prirode njihovog preživljavanja i procesa
interakcije sa fitopatogenim bakterijama, ali i sa drugim činiocima mikrobioma i životnom
sredinom uopšte. U većini slučajeva, efikasna primena takvih jedinjenja i zadovoljavajući
efekat njihove biološke aktivnosti zahtevaju razvoj posebnih tehnika ili kombinaciju više od
jednog agensa. Međutim, uprkos nedavno povećanom broju i raznolikosti istraživačkih
programa, mora se priznati da su broj i dostupnost komercijalnih biobaktericida i dalje
ograničeni.
PB  - Društvo za zaštitu bilja
C3  - XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021
T1  - NOVI TRENDOVI U BIOLOŠKOJ KONTROLI FITOPATOGENIH BAKTERIJA
SP  - 9
ER  - 

@conference{
author = "Obradović, Aleksa and Menković, Jelena and Prokić, Anđelka and Ivanović, Milan and Zlatković, Nevena and Gašić, Katarina",
year = "2021",
abstract = "Glavni cilj istraživanja fitopatogenih bakterija je njihovo bolje poznavanje i razvoj
efikasne strategije zaštite. Klimatske promene, globalna distribucija reproduktivnog biljnog
materijala, evolucija poljoprivredne prakse i povećana zabrinutost za životnu sredinu,
zahtevaju nove pristupe kontroli bakterioza biljaka. Stoga je mogućnost primene prirodnih,
zdravstveno i ekološki prihvatljivih mehanizama kontrole fitopatogenih bakterija, izazvala
povećano interesovanje biljnih bakteriologa. Biološka kontrola, kao novi oslonac integrisanih
strategija kontrole biljnih bolesti, mogla bi doprineti prihvatljivoj efikasnosti i održivosti
trenutnih mera zaštite. Strategije biološke kontrole se uglavnom zasnivaju na sprečavanjju
nastanka infekcije, smanjenju učestalosti bakterioza biljaka bilo selektovanom ili
indukovanom otpornošću, konkurencijom, antibiozom ili ometanjem životnog ciklusa
patogena. Većina poznatih bioloških agenasa pripada rodovima Bacillus, Lactobacillus,
Erwinia, Pantoea, Streptomyces, Bdellovibrio, fluorescentnim Pseudomonas spp.,
bakteriofagima i protozoama. Neki takođe uključuju avirulentne oblike patogenih sojeva. Kao
jedna od ciljanih tačaka, osim samih bakterijskih ćelija, nameće se ometanje formiranja
biofilma ili manipulacija fizioloških procesa bakterije upotrebom signalnih molekula. Novija
istraživanja takođe ukazuju da bi se značajan napredak u ispoljavanju konkurentnosti i
sposobnosti bioloških agensa u proizvodnji antimikrobnih metabolita ili izazivanju otpornosti
biljaka mogao postići boljim razumevanjem prirode njihovog preživljavanja i procesa
interakcije sa fitopatogenim bakterijama, ali i sa drugim činiocima mikrobioma i životnom
sredinom uopšte. U većini slučajeva, efikasna primena takvih jedinjenja i zadovoljavajući
efekat njihove biološke aktivnosti zahtevaju razvoj posebnih tehnika ili kombinaciju više od
jednog agensa. Međutim, uprkos nedavno povećanom broju i raznolikosti istraživačkih
programa, mora se priznati da su broj i dostupnost komercijalnih biobaktericida i dalje
ograničeni.",
publisher = "Društvo za zaštitu bilja",
journal = "XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021",
title = "NOVI TRENDOVI U BIOLOŠKOJ KONTROLI FITOPATOGENIH BAKTERIJA",
pages = "9"
}

Obradović, A., Menković, J., Prokić, A., Ivanović, M., Zlatković, N.,& Gašić, K.. (2021). NOVI TRENDOVI U BIOLOŠKOJ KONTROLI FITOPATOGENIH BAKTERIJA. in XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021
Društvo za zaštitu bilja., 9.

Obradović A, Menković J, Prokić A, Ivanović M, Zlatković N, Gašić K. NOVI TRENDOVI U BIOLOŠKOJ KONTROLI FITOPATOGENIH BAKTERIJA. in XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021. 2021;:9..

Obradović, Aleksa, Menković, Jelena, Prokić, Anđelka, Ivanović, Milan, Zlatković, Nevena, Gašić, Katarina, "NOVI TRENDOVI U BIOLOŠKOJ KONTROLI FITOPATOGENIH BAKTERIJA" in XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021 (2021):9.

TY  - CHAP
AU  - Ivanović, Milan
AU  - Prokić, Anđelka
AU  - Menković, Jelena
AU  - Gašić, Katarina
AU  - Zlatković, Nevena
AU  - Obradović, Aleksa
PY  - 2021
UR  - https://plantarum.izbis.bg.ac.rs/handle/123456789/1281
AB  - Bakteriozna plamenjača jabučastih voćaka, koju prouzrokuje bakterija Erwinia
amylovora, predstavlja jednu od najštetnijih bakterioza na našim prostorima. Detekcija
bakterije u biljnom materijalu moguća je primenom lančanog umnožavanja specifičnih
fragmenata nukleinske kiseline (PCR) korišćenjem većeg broja setova specifičnih prajmera. U
cilju povećanja specifičnosti i brzine detekcije ovog patogena, razvijene su nove, osetljivije
metode kao što su „nested“ ili Real-time PCR. Jedna od najsavremenijih molekularnih tehnika
za detekciju E. amylovora je tzv. izotermna amplifikacija nukleniske kiseline posredstvom
petlje (Eng. Loop-Mediated Isothermal Amplification, LAMP). LAMP se zasniva na postulatima
konvencionalnog PCR-a i fluorimetrije uz upotrebu 3 para prajmera koji formiraju DNK
molekul nalik petlji, povećavajući specifičnost metode. Tokom reakcije, interkalirajuća boja
vezuje se za novosintetisane molekule DNK, što omogućava detekciju i relativnu kvantifikaciju
bakterijske DNK u uzorku u realnom vremenu. Najznačajnija prednost LAMP metode je
mogućnost umnožavanja specifičnih sekvenci pod izotermnim uslovima između 63 i 65 °C, pri
čemu ne dolazi do gubitka vremena u termičkim promenama, ujedno otklanjajući potrebu za
termosajklerom - uređajem neophodnim za ostale PCR tehnike.
U ovom radu, za detekciju E. amylovora u ekstraktu kruške i kontrolnoj suspenziji
bakterija različite koncentracije korišćen je prenosivi aparat ICGENE mini (Enbiotech, Italija), a
ekstrakcija i umnožavanje DNK obavljene su prema uputstvu proizvođača. Ova metoda koristi
šest prajmera koji detektuju vrlo konzerviranu sekvencu hromozomskog amsH gena, specifičnu
za E. amylovora. Unapred pripremljeni prajmeri nalaze se u liofilizovanom stanju u reakcionim
mikroepruvetama kako bi se smanjila mogućnost greške pipetiranjem tokom pripreme reakcije.
Osetljivost metode proučena je korišćenjem serije razređenja bakterijske suspenzije soja E.
amylovora KFB 159. Za proučavanje uticaja inhibitornih materija iz biljnog tkiva na osetljivost
metode korišćena je smeša bakterijske suspenzije i ekstrakta mladara kruške.
Primenom LAMP metode moguće je detektovati DNK E. amylovora u biljnom materijalu
za manje od 1h, dok je pomoću Real-time PCR-a potrebno oko 3h, a konvencionalnim PCR-om
preko 6h. U poređenju sa konvencionalnom PCR metodom, LAMP je jednostavnija i brža
metoda, pri čemu nema rukovanja PCR produktima, elektroforeze, bojenja i slikanja gela.
Rezultati pokazuju da je najniža detektovana koncentracija bakterija u ekstraktu kruške bila
1,38106 bakterija/ml, što je u poređenju sa drugim metodama nedovoljno osetljivo. Nešto
veća osetljivost zabeležena je u detekciji bakterija u kontrolnoj suspenziji bez biljnog
ekstrakta (2,3103 bakterija/ml). Rezultati ukazuju da je detekcija E. amylovora LAMP
metodom brza i jednostavna, ali da prisustvo biljnog ekstrakta značajno umanjuje osetljivost
metode. Negativan uticaj inhibitornih materija iz biljnog materijala se mora otkloniti
optimizacijom metode kako bi mogla da zameni postojeće PCR tehnike.
PB  - Društvo za zaštitu bilja
T2  - XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021
T1  - DETEKCIJA Erwinia amylovora PRIMENOM LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION (LAMP) METODE
SP  - 47
ER  - 

@inbook{
author = "Ivanović, Milan and Prokić, Anđelka and Menković, Jelena and Gašić, Katarina and Zlatković, Nevena and Obradović, Aleksa",
year = "2021",
abstract = "Bakteriozna plamenjača jabučastih voćaka, koju prouzrokuje bakterija Erwinia
amylovora, predstavlja jednu od najštetnijih bakterioza na našim prostorima. Detekcija
bakterije u biljnom materijalu moguća je primenom lančanog umnožavanja specifičnih
fragmenata nukleinske kiseline (PCR) korišćenjem većeg broja setova specifičnih prajmera. U
cilju povećanja specifičnosti i brzine detekcije ovog patogena, razvijene su nove, osetljivije
metode kao što su „nested“ ili Real-time PCR. Jedna od najsavremenijih molekularnih tehnika
za detekciju E. amylovora je tzv. izotermna amplifikacija nukleniske kiseline posredstvom
petlje (Eng. Loop-Mediated Isothermal Amplification, LAMP). LAMP se zasniva na postulatima
konvencionalnog PCR-a i fluorimetrije uz upotrebu 3 para prajmera koji formiraju DNK
molekul nalik petlji, povećavajući specifičnost metode. Tokom reakcije, interkalirajuća boja
vezuje se za novosintetisane molekule DNK, što omogućava detekciju i relativnu kvantifikaciju
bakterijske DNK u uzorku u realnom vremenu. Najznačajnija prednost LAMP metode je
mogućnost umnožavanja specifičnih sekvenci pod izotermnim uslovima između 63 i 65 °C, pri
čemu ne dolazi do gubitka vremena u termičkim promenama, ujedno otklanjajući potrebu za
termosajklerom - uređajem neophodnim za ostale PCR tehnike.
U ovom radu, za detekciju E. amylovora u ekstraktu kruške i kontrolnoj suspenziji
bakterija različite koncentracije korišćen je prenosivi aparat ICGENE mini (Enbiotech, Italija), a
ekstrakcija i umnožavanje DNK obavljene su prema uputstvu proizvođača. Ova metoda koristi
šest prajmera koji detektuju vrlo konzerviranu sekvencu hromozomskog amsH gena, specifičnu
za E. amylovora. Unapred pripremljeni prajmeri nalaze se u liofilizovanom stanju u reakcionim
mikroepruvetama kako bi se smanjila mogućnost greške pipetiranjem tokom pripreme reakcije.
Osetljivost metode proučena je korišćenjem serije razređenja bakterijske suspenzije soja E.
amylovora KFB 159. Za proučavanje uticaja inhibitornih materija iz biljnog tkiva na osetljivost
metode korišćena je smeša bakterijske suspenzije i ekstrakta mladara kruške.
Primenom LAMP metode moguće je detektovati DNK E. amylovora u biljnom materijalu
za manje od 1h, dok je pomoću Real-time PCR-a potrebno oko 3h, a konvencionalnim PCR-om
preko 6h. U poređenju sa konvencionalnom PCR metodom, LAMP je jednostavnija i brža
metoda, pri čemu nema rukovanja PCR produktima, elektroforeze, bojenja i slikanja gela.
Rezultati pokazuju da je najniža detektovana koncentracija bakterija u ekstraktu kruške bila
1,38106 bakterija/ml, što je u poređenju sa drugim metodama nedovoljno osetljivo. Nešto
veća osetljivost zabeležena je u detekciji bakterija u kontrolnoj suspenziji bez biljnog
ekstrakta (2,3103 bakterija/ml). Rezultati ukazuju da je detekcija E. amylovora LAMP
metodom brza i jednostavna, ali da prisustvo biljnog ekstrakta značajno umanjuje osetljivost
metode. Negativan uticaj inhibitornih materija iz biljnog materijala se mora otkloniti
optimizacijom metode kako bi mogla da zameni postojeće PCR tehnike.",
publisher = "Društvo za zaštitu bilja",
journal = "XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021",
booktitle = "DETEKCIJA Erwinia amylovora PRIMENOM LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION (LAMP) METODE",
pages = "47"
}

Ivanović, M., Prokić, A., Menković, J., Gašić, K., Zlatković, N.,& Obradović, A.. (2021). DETEKCIJA Erwinia amylovora PRIMENOM LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION (LAMP) METODE. in XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021
Društvo za zaštitu bilja., 47.

Ivanović M, Prokić A, Menković J, Gašić K, Zlatković N, Obradović A. DETEKCIJA Erwinia amylovora PRIMENOM LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION (LAMP) METODE. in XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021. 2021;:47..

Ivanović, Milan, Prokić, Anđelka, Menković, Jelena, Gašić, Katarina, Zlatković, Nevena, Obradović, Aleksa, "DETEKCIJA Erwinia amylovora PRIMENOM LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION (LAMP) METODE" in XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021 (2021):47.

TY  - CONF
AU  - Popović, Tamara
AU  - Menković, Jelena
AU  - Prokić, Anđelka
AU  - Zlatković, Nevena
AU  - Obradović, Aleksa
PY  - 2021
UR  - https://plantarum.izbis.bg.ac.rs/handle/123456789/1278
AB  - Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) prouzrokovač bakterioznog raka je značajan
patogen koštičavih voćaka i badema širom svijeta. U Crnoj Gori Pss kao patogen koštičavih
voćaka i badema nije detaljnije proučen. Tokom dvogodišnjeg nadzora (2017-2018),
prikupljeni su simptomatični uzorci raznih organa koštičavih voćaka i badema, iz različitih
lokaliteta širom Crne Gore. Na oboljelim voćkama uočavali su se različiti simptomi: nekroza i
rak-rane na granama, često praćene isticanjem smole; sušenje grančica i grana; pjegavost
listova; nekroza pupoljaka i lisnih drški. Iz oboljelog tkiva, izolovano je 29 sojeva
fitopatogenih bakterija koji su proučeni primjenom klasičnih i specifičnih diferencijalnih
bakterioloških testova, kao i molekularnih metoda. Na podlozi od hranljivog agara (HA)
proučavani sojevi formirali su ispupčene, sjajne, sivobjeličaste krupne kolonije. Patogenost
proučavanih sojeva potvrđena je reprodukcijom simptoma na listovima, plodovima i
21
mladarima odgovarajućih biljaka domaćina. Proučavani sojevi stvaraju zeleni fluorescentni
pigment na Kingovoj podlozi B. Svi proučavani sojevi su Gram negativni, stvaraju katalazu, ali
ne i oksidazu, imaju oksidativan metabolizam glukoze i prouzrokuju hipersenzitivnu reakciju
lista duvana i muškatle. Uočena je varijabilnost u pogledu stvaranja levana i vitalnosti na
hranljivoj podlozi obogaćenoj saharozom (NAS), kao i sposobnosti stvaranja čestica leda.
Rezultati GATTa testova nisu bili dovoljni i pouzdani za diferencijaciju P. syringae sojeva do ili
ispod nivoa patogenog varijeteta. Kod 25 proučavanih sojeva detektovan je syrB gen koji
kodira sintezu sringomicina. Rezultati Rep-PCR primjenom BOX prajmera, pokazali su visok
genetički diverzitet među proučavanim sojevima. Analiza multilokusnih sekvenci (MLSA) je
izvedena za 28 proučavanih sojeva, pri čemu su umnožene nukleotidne sekvence 4
konstitutivna gena: gapA, gltA, gyrB i rpoD. Rezultati MLSA pokazuju da 27 proučavanih
sojeva pripada genomskoj vrsti 1, P. syringae sensu stricto, raspoređenih u filogrupi 2.
Međutim, sojevi iz iste filogrupe 2, nisu grupisani u jedan monofiletski klaster. Izuzetak je
predstavljao soj K6 izolovan iz kajsije, koji pripada genomskoj vrsti 2, filogrupi 3. Kod četiri
soja kod kojih nije detektovan gen za sintezu siringomicina, analiziran je 16S rRNK gen.
Poređenjem dobijenih sekvenci sa sekvencama u NCBI bazi, utvrđeno je da ti sojevi ipak
pripadaju vrsti Pss. Na osnovu dobijenih rezultata, 28 sojeva je identifikovano kao Pss.
Izuzetak je soj K6 čija taksonomska kategorija još uvek nije utvrđena.
PB  - Društvo za zaštitu bilja
C3  - XVI Savetovanje o zaštiti bilja, 22-25. februar 2021. godine, Zlatibor, Srbija. Zbornik rezimea
T1  - POPULACIJA Pseudomonas syringae pv. syringae - PATOGENA KOŠTIČAVIH VOĆAKA I BADEMA U CRNOJ GORI
EP  - 21
SP  - 20
ER  - 

@conference{
author = "Popović, Tamara and Menković, Jelena and Prokić, Anđelka and Zlatković, Nevena and Obradović, Aleksa",
year = "2021",
abstract = "Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) prouzrokovač bakterioznog raka je značajan
patogen koštičavih voćaka i badema širom svijeta. U Crnoj Gori Pss kao patogen koštičavih
voćaka i badema nije detaljnije proučen. Tokom dvogodišnjeg nadzora (2017-2018),
prikupljeni su simptomatični uzorci raznih organa koštičavih voćaka i badema, iz različitih
lokaliteta širom Crne Gore. Na oboljelim voćkama uočavali su se različiti simptomi: nekroza i
rak-rane na granama, često praćene isticanjem smole; sušenje grančica i grana; pjegavost
listova; nekroza pupoljaka i lisnih drški. Iz oboljelog tkiva, izolovano je 29 sojeva
fitopatogenih bakterija koji su proučeni primjenom klasičnih i specifičnih diferencijalnih
bakterioloških testova, kao i molekularnih metoda. Na podlozi od hranljivog agara (HA)
proučavani sojevi formirali su ispupčene, sjajne, sivobjeličaste krupne kolonije. Patogenost
proučavanih sojeva potvrđena je reprodukcijom simptoma na listovima, plodovima i
21
mladarima odgovarajućih biljaka domaćina. Proučavani sojevi stvaraju zeleni fluorescentni
pigment na Kingovoj podlozi B. Svi proučavani sojevi su Gram negativni, stvaraju katalazu, ali
ne i oksidazu, imaju oksidativan metabolizam glukoze i prouzrokuju hipersenzitivnu reakciju
lista duvana i muškatle. Uočena je varijabilnost u pogledu stvaranja levana i vitalnosti na
hranljivoj podlozi obogaćenoj saharozom (NAS), kao i sposobnosti stvaranja čestica leda.
Rezultati GATTa testova nisu bili dovoljni i pouzdani za diferencijaciju P. syringae sojeva do ili
ispod nivoa patogenog varijeteta. Kod 25 proučavanih sojeva detektovan je syrB gen koji
kodira sintezu sringomicina. Rezultati Rep-PCR primjenom BOX prajmera, pokazali su visok
genetički diverzitet među proučavanim sojevima. Analiza multilokusnih sekvenci (MLSA) je
izvedena za 28 proučavanih sojeva, pri čemu su umnožene nukleotidne sekvence 4
konstitutivna gena: gapA, gltA, gyrB i rpoD. Rezultati MLSA pokazuju da 27 proučavanih
sojeva pripada genomskoj vrsti 1, P. syringae sensu stricto, raspoređenih u filogrupi 2.
Međutim, sojevi iz iste filogrupe 2, nisu grupisani u jedan monofiletski klaster. Izuzetak je
predstavljao soj K6 izolovan iz kajsije, koji pripada genomskoj vrsti 2, filogrupi 3. Kod četiri
soja kod kojih nije detektovan gen za sintezu siringomicina, analiziran je 16S rRNK gen.
Poređenjem dobijenih sekvenci sa sekvencama u NCBI bazi, utvrđeno je da ti sojevi ipak
pripadaju vrsti Pss. Na osnovu dobijenih rezultata, 28 sojeva je identifikovano kao Pss.
Izuzetak je soj K6 čija taksonomska kategorija još uvek nije utvrđena.",
publisher = "Društvo za zaštitu bilja",
journal = "XVI Savetovanje o zaštiti bilja, 22-25. februar 2021. godine, Zlatibor, Srbija. Zbornik rezimea",
title = "POPULACIJA Pseudomonas syringae pv. syringae - PATOGENA KOŠTIČAVIH VOĆAKA I BADEMA U CRNOJ GORI",
pages = "21-20"
}

Popović, T., Menković, J., Prokić, A., Zlatković, N.,& Obradović, A.. (2021). POPULACIJA Pseudomonas syringae pv. syringae - PATOGENA KOŠTIČAVIH VOĆAKA I BADEMA U CRNOJ GORI. in XVI Savetovanje o zaštiti bilja, 22-25. februar 2021. godine, Zlatibor, Srbija. Zbornik rezimea
Društvo za zaštitu bilja., 20-21.

Popović T, Menković J, Prokić A, Zlatković N, Obradović A. POPULACIJA Pseudomonas syringae pv. syringae - PATOGENA KOŠTIČAVIH VOĆAKA I BADEMA U CRNOJ GORI. in XVI Savetovanje o zaštiti bilja, 22-25. februar 2021. godine, Zlatibor, Srbija. Zbornik rezimea. 2021;:20-21..

Popović, Tamara, Menković, Jelena, Prokić, Anđelka, Zlatković, Nevena, Obradović, Aleksa, "POPULACIJA Pseudomonas syringae pv. syringae - PATOGENA KOŠTIČAVIH VOĆAKA I BADEMA U CRNOJ GORI" in XVI Savetovanje o zaštiti bilja, 22-25. februar 2021. godine, Zlatibor, Srbija. Zbornik rezimea (2021):20-21.

TY  - CONF
AU  - Ivanović, Milan M
AU  - Šević, Milan
AU  - Prokić, Anđelka
AU  - Gašić, Katarina
AU  - Zlatković, Nevena
AU  - Menković, Jelena
AU  - Obradović, Aleksa
PY  - 2021
UR  - https://plantarum.izbis.bg.ac.rs/handle/123456789/1275
AB  - biljaka u vidu guste sadnje, korišćenja osetljivih podloga i novih, osetljivih sorti, doprinose
češćoj i jačoj pojavi bolesti biljaka. U tom pogledu bakteriozna obolenja ne predstavljaju
izuzetak. U uslovima pogodnim za razvoj i širenje bolesti, fitopatogene bakterije za kratko
vreme mogu pričiniti ogromne štete.
Ukrupnjavanje poseda i velike površine pod jednom biljnom vrstom, osim što stvaraju
uslove za brzo širenje patogena, često smanjuju mogućnost i efekte primene preventivnih
agrotehničkih, mehaničkih, fizičkih i bioloških mera zaštite. U takvoj situaciji proizvođači se
uglavnom odlučuju za mere intervencije odnosno zaštitu hemijskim sredstvima. Jedan od
načina kontrole bakterioznih oboljenja je primena preparata na bazi bakra. Međutim,
ograničena primena tokom mirovanja ili do određene fenofaze razvoja biljaka, fitotoksičnost
jona bakra usled niskih temperatura i pojava rezistentnosti fitopatogenih bakterija dovode u
pitanje efikasnost bakarnih preparata. Stoga se u pojedinim državama za suzbijanje
fitopatogenih bakterija koriste i antibiotici. To su proizvodi biološke sinteze aktinomiceta,
bakterija i gljiva, ili hemijski sintetisane materije koji deluju inhibitorno na mikroorganizme.
Ipak, upotrebu antibiotika u zaštiti bilja prate mnoge kontroverze, ali i zablude.
Neke od osnovanih bojazni vezane za upotrebu antibiotika u zaštiti bilja su: razvoj
rezistentnih sojeva bakterija, rizik od transfera gena rezistentnosti iz poljoprivredne sredine u
humanu populaciju, uticaj na neciljane mikroorganizme i smanjenje genetičkog diverziteta,
kao i pitanje ostataka antibiotika u biljnim proizvodima i posledice koje mogu nastati zbog
toga.
S druge strane, jedna od najvećih zabluda je da se antibiotici široko primenjuju u zaštiti
bilja od bakterioznih obolenja. Iskustva iz SAD zapravo pokazuju da se antibiotici u zaštit bilja
u najvećoj meri koriste u kontroli jednog obolenja: bakteriozne plamenjače jabučastih voćaka.
Količina upotrebljenih antibiotika u zaštiti bilja u SAD su zanemarljivo male, svega 0,26%, dok
se preostali deo upotrebi u uzgoju životinja. U našoj zemlji nije dozvoljena upotreba
antibiotika u zaštiti bilja. Ipak, situacija na terenu ukazuje na njihovo nedozvoljeno korišćenje
u pojedinim slučajevima. Dodatnu opasnost predstavlja aktivna materija koja se tom prilikom
koristi, a to je streptomicin sulfat koji je zapravo registrovan za primenu u veterinarskoj
medicini, a ne kao formulacija prilagođena zaštiti bilja. Takva praksa stvara uslove za
ostvarenje navedenih bojazni, a takođe može ugroziti poverenje domaćih potrošača kao i
plasman poljoprivrednih proizvoda na inostrano tržište. Pojedine evropske zemlje poput Austrije, Švajcarske i Nemačke regulisale su upotrebu antibiotika u zaštiti od bakteriozne
plamenjače izdavanjem specijalnih dozvola od strane nadležnih institucija u godinama kada se
proceni da postoji jak infekcioni pritisak i povoljni uslovi za razvoj bolesti. Možda je model
strogo kontrolisane upotrebe onaj koji bi zadovoljio sve strane: proizvođače, potrošače i
zakonodavca, a sve u cilju smanjenja neodgovorne upotrebe antibiotika u zaštiti bilja.
PB  - Društvo za zaštitu bilja
C3  - XVI Savetovanje o zaštiti bilja, 22-25. februar 2021., Zlatibor
T1  - PRIMENA ANTIBIOTIKA U ZAŠTITI BILJA – ZA I PROTIV
EP  - 30
SP  - 29
ER  - 

@conference{
author = "Ivanović, Milan M and Šević, Milan and Prokić, Anđelka and Gašić, Katarina and Zlatković, Nevena and Menković, Jelena and Obradović, Aleksa",
year = "2021",
abstract = "biljaka u vidu guste sadnje, korišćenja osetljivih podloga i novih, osetljivih sorti, doprinose
češćoj i jačoj pojavi bolesti biljaka. U tom pogledu bakteriozna obolenja ne predstavljaju
izuzetak. U uslovima pogodnim za razvoj i širenje bolesti, fitopatogene bakterije za kratko
vreme mogu pričiniti ogromne štete.
Ukrupnjavanje poseda i velike površine pod jednom biljnom vrstom, osim što stvaraju
uslove za brzo širenje patogena, često smanjuju mogućnost i efekte primene preventivnih
agrotehničkih, mehaničkih, fizičkih i bioloških mera zaštite. U takvoj situaciji proizvođači se
uglavnom odlučuju za mere intervencije odnosno zaštitu hemijskim sredstvima. Jedan od
načina kontrole bakterioznih oboljenja je primena preparata na bazi bakra. Međutim,
ograničena primena tokom mirovanja ili do određene fenofaze razvoja biljaka, fitotoksičnost
jona bakra usled niskih temperatura i pojava rezistentnosti fitopatogenih bakterija dovode u
pitanje efikasnost bakarnih preparata. Stoga se u pojedinim državama za suzbijanje
fitopatogenih bakterija koriste i antibiotici. To su proizvodi biološke sinteze aktinomiceta,
bakterija i gljiva, ili hemijski sintetisane materije koji deluju inhibitorno na mikroorganizme.
Ipak, upotrebu antibiotika u zaštiti bilja prate mnoge kontroverze, ali i zablude.
Neke od osnovanih bojazni vezane za upotrebu antibiotika u zaštiti bilja su: razvoj
rezistentnih sojeva bakterija, rizik od transfera gena rezistentnosti iz poljoprivredne sredine u
humanu populaciju, uticaj na neciljane mikroorganizme i smanjenje genetičkog diverziteta,
kao i pitanje ostataka antibiotika u biljnim proizvodima i posledice koje mogu nastati zbog
toga.
S druge strane, jedna od najvećih zabluda je da se antibiotici široko primenjuju u zaštiti
bilja od bakterioznih obolenja. Iskustva iz SAD zapravo pokazuju da se antibiotici u zaštit bilja
u najvećoj meri koriste u kontroli jednog obolenja: bakteriozne plamenjače jabučastih voćaka.
Količina upotrebljenih antibiotika u zaštiti bilja u SAD su zanemarljivo male, svega 0,26%, dok
se preostali deo upotrebi u uzgoju životinja. U našoj zemlji nije dozvoljena upotreba
antibiotika u zaštiti bilja. Ipak, situacija na terenu ukazuje na njihovo nedozvoljeno korišćenje
u pojedinim slučajevima. Dodatnu opasnost predstavlja aktivna materija koja se tom prilikom
koristi, a to je streptomicin sulfat koji je zapravo registrovan za primenu u veterinarskoj
medicini, a ne kao formulacija prilagođena zaštiti bilja. Takva praksa stvara uslove za
ostvarenje navedenih bojazni, a takođe može ugroziti poverenje domaćih potrošača kao i
plasman poljoprivrednih proizvoda na inostrano tržište. Pojedine evropske zemlje poput Austrije, Švajcarske i Nemačke regulisale su upotrebu antibiotika u zaštiti od bakteriozne
plamenjače izdavanjem specijalnih dozvola od strane nadležnih institucija u godinama kada se
proceni da postoji jak infekcioni pritisak i povoljni uslovi za razvoj bolesti. Možda je model
strogo kontrolisane upotrebe onaj koji bi zadovoljio sve strane: proizvođače, potrošače i
zakonodavca, a sve u cilju smanjenja neodgovorne upotrebe antibiotika u zaštiti bilja.",
publisher = "Društvo za zaštitu bilja",
journal = "XVI Savetovanje o zaštiti bilja, 22-25. februar 2021., Zlatibor",
title = "PRIMENA ANTIBIOTIKA U ZAŠTITI BILJA – ZA I PROTIV",
pages = "30-29"
}

Ivanović, M. M., Šević, M., Prokić, A., Gašić, K., Zlatković, N., Menković, J.,& Obradović, A.. (2021). PRIMENA ANTIBIOTIKA U ZAŠTITI BILJA – ZA I PROTIV. in XVI Savetovanje o zaštiti bilja, 22-25. februar 2021., Zlatibor
Društvo za zaštitu bilja., 29-30.

Ivanović MM, Šević M, Prokić A, Gašić K, Zlatković N, Menković J, Obradović A. PRIMENA ANTIBIOTIKA U ZAŠTITI BILJA – ZA I PROTIV. in XVI Savetovanje o zaštiti bilja, 22-25. februar 2021., Zlatibor. 2021;:29-30..

Ivanović, Milan M, Šević, Milan, Prokić, Anđelka, Gašić, Katarina, Zlatković, Nevena, Menković, Jelena, Obradović, Aleksa, "PRIMENA ANTIBIOTIKA U ZAŠTITI BILJA – ZA I PROTIV" in XVI Savetovanje o zaštiti bilja, 22-25. februar 2021., Zlatibor (2021):29-30.

TY  - JOUR
AU  - Popović Milovanović, Tatjana
AU  - Menković, Jelena
AU  - Prokić, Anđelka
AU  - Zlatković, Nevena
AU  - Obradović, Aleksa
PY  - 2021
UR  - https://enauka.gov.rs/handle/123456789/776640
UR  - https://plantarum.izbis.bg.ac.rs/handle/123456789/1185
AB  - In Montenegro, stone fruit species are grown on intensive and semi-intensive commercial plantations. However, almond production is mainly organized on family gardens and for household consumption. During two seasons (2017–2018), we surveyed apricot, peach, nectarine, sweet cherry, Japanese plum, and almond orchards for the presence of bacterial diseases at different geographical locations in Montenegro. From leaf, petiole and fruit lesions, branch or twig cankers, and necrotizing buds, a total of 29 isolates were obtained and subjected to identification based on their morphological, pathogenic, biochemical, and molecular characteristics. Pathogenicity of the isolates was confirmed by reproducing the symptoms on leaves, fruits, and twigs of the corresponding host plants. The biochemical tests indicated that the isolates belong to Pseudomonas syringae. However, isolates’ characterization showed variation in their phenotypic and molecular features. The presence of the syrB gene and ice nucleation activity grouped most of the isolates within pathovar syringae. The results of rep-PCR using the BOX primer revealed high genetic diversity of isolates. Multilocus sequence analysis (MLSA), using four housekeeping genes, showed that 27 isolates belong to the genomic species 1, P. syringae sensu stricto, corresponding to P. syringae phylogroup 2. However, isolates from the same phylogroup 2 did not form a monophyletic group. One strain isolated from apricot was most distinct and similar to members of genomic species 2, phylogroup 3. All tested isolates showed significant levels of resistance to copper sulfate and high level of sensitivity to streptomycin sulfate in vitro.
PB  - Springer
T2  - Journal of Plant Diseases and Protection
T1  - Isolation and characterization of Pseudomonas syringae isolates affecting stone fruits and almond in Montenegro
EP  - 405
IS  - 2
SP  - 391
VL  - 128
DO  - 10.1007/s41348-020-00417-8
ER  - 

@article{
author = "Popović Milovanović, Tatjana and Menković, Jelena and Prokić, Anđelka and Zlatković, Nevena and Obradović, Aleksa",
year = "2021",
abstract = "In Montenegro, stone fruit species are grown on intensive and semi-intensive commercial plantations. However, almond production is mainly organized on family gardens and for household consumption. During two seasons (2017–2018), we surveyed apricot, peach, nectarine, sweet cherry, Japanese plum, and almond orchards for the presence of bacterial diseases at different geographical locations in Montenegro. From leaf, petiole and fruit lesions, branch or twig cankers, and necrotizing buds, a total of 29 isolates were obtained and subjected to identification based on their morphological, pathogenic, biochemical, and molecular characteristics. Pathogenicity of the isolates was confirmed by reproducing the symptoms on leaves, fruits, and twigs of the corresponding host plants. The biochemical tests indicated that the isolates belong to Pseudomonas syringae. However, isolates’ characterization showed variation in their phenotypic and molecular features. The presence of the syrB gene and ice nucleation activity grouped most of the isolates within pathovar syringae. The results of rep-PCR using the BOX primer revealed high genetic diversity of isolates. Multilocus sequence analysis (MLSA), using four housekeeping genes, showed that 27 isolates belong to the genomic species 1, P. syringae sensu stricto, corresponding to P. syringae phylogroup 2. However, isolates from the same phylogroup 2 did not form a monophyletic group. One strain isolated from apricot was most distinct and similar to members of genomic species 2, phylogroup 3. All tested isolates showed significant levels of resistance to copper sulfate and high level of sensitivity to streptomycin sulfate in vitro.",
publisher = "Springer",
journal = "Journal of Plant Diseases and Protection",
title = "Isolation and characterization of Pseudomonas syringae isolates affecting stone fruits and almond in Montenegro",
pages = "405-391",
number = "2",
volume = "128",
doi = "10.1007/s41348-020-00417-8"
}

Popović Milovanović, T., Menković, J., Prokić, A., Zlatković, N.,& Obradović, A.. (2021). Isolation and characterization of Pseudomonas syringae isolates affecting stone fruits and almond in Montenegro. in Journal of Plant Diseases and Protection
Springer., 128(2), 391-405.
https://doi.org/10.1007/s41348-020-00417-8

Popović Milovanović T, Menković J, Prokić A, Zlatković N, Obradović A. Isolation and characterization of Pseudomonas syringae isolates affecting stone fruits and almond in Montenegro. in Journal of Plant Diseases and Protection. 2021;128(2):391-405.
doi:10.1007/s41348-020-00417-8 .

Popović Milovanović, Tatjana, Menković, Jelena, Prokić, Anđelka, Zlatković, Nevena, Obradović, Aleksa, "Isolation and characterization of Pseudomonas syringae isolates affecting stone fruits and almond in Montenegro" in Journal of Plant Diseases and Protection, 128, no. 2 (2021):391-405,
https://doi.org/10.1007/s41348-020-00417-8 . .