Iličić, Renata

Link to this page

Authority KeyName Variants
2d56bd6b-98e7-4b46-8574-4860a5864dfe
  • Iličić, Renata (5)
Projects

Author's Bibliography

Novija proučavanja uzročnika bakteriozne pegavosti lista šećerne repe

Popović Milovanović, Tatjana; Trkulja, Nenad; Ristić, Danijela; Iličić, Renata; Trkulja, Vojislav; Jelušić, Aleksandra

(Društvo za zaštitu bilja, 2023)

TY  - CONF
AU  - Popović Milovanović, Tatjana
AU  - Trkulja, Nenad
AU  - Ristić, Danijela
AU  - Iličić, Renata
AU  - Trkulja, Vojislav
AU  - Jelušić, Aleksandra
PY  - 2023
UR  - https://plantarum.izbis.bg.ac.rs/handle/123456789/1197
AB  - Bakteriozna pegavost lista šećerne repe prouzrokovana fitopatogenom bakterijom
Pseudomonas syringae pv. aptata (Psa) je široko rasprostranjena bolest, koja osim ove biljne
kulture napada blitvu, cveklu i dr. Ova bolest se poslednjih godina sve češće javlja na usevima
šećerne repe u Srbiji, posebno u uslovima prohladnog i vlažnog proleća. Epifitocije su
beležene 2013. godine u centralnim i južnim delovima Vojvodine (Bačka i Srem), kada su na
osnovu sekvenciranja konzervativnog gena gyrB, utvrđene četiri različite alelske varijante
ovog patogena. Obzirom na noviju epifitociju bakteriozne pegavosti lista na području gajenja
šećerne repe u Srbiji, cilj ovoga rada je bio da se izvrši izolacija i identifikacija prouzrokovača i
determiniše njegov genetički diverzitet na osnovu analize ponavljajućih palindromskih
sekvenci (rep-PCR) i nasumično amplifikovanih polimorfnih DNK (RAPD-PCR).
Tokom 2023. godine na šećernoj repi (sorta Viola) u lokalitetima Ruski Krstur i Srpski
Miletić prikupljeni su uzorci obolelog lišća sa simptomima bakteriozne pegavosti u vidu
nepravilnih nekrotičnih pega, oivičenih tamnijim marginama, sa centralnim delom mrke do
sive boje. U nekim slučajevima pege su se spajale čineći veću nekrotičnu leziju. Izolacija je
vršena na hranljivu podlogu obogaćenu sa 5% saharoze (NAS), na kojoj su nakon tri dana
inkubacije na 26 °C, dominirale beličaste, okrugle, sjajne i ispupčene bakterijske kolonije. Za
dalji rad je odabrano 18 izolata, a kao uporedni poslužili su referentni Psa sojevi, PD193 i
PD197. Prema rezultatima LOPAT testova, svi izolati su pokazali pripadnost Ia grupi
fluorescentnih Pseudomonas (+---+). Patogenost je dokazana infiltracijom bakterijske
suspenzije u list šećerne repe. Pripadnost izolata bakteriji Psa dokazana je PCR metodom
primenom prajmera specifičnih za patovar Papt2F/1R kojima su amplifikovani fragmenti DNK
veličine 250 bp karakteristični za Psa. Rep-PCR je izvođen primenom prajmera BOXA1R (BOXPCR), ERIC1R/ERIC2 (ERIC-PCR) i GTG5 (GTG5-PCR), dok je RAPD-PCR rađen primenom
prajmera M13 za M13-PCR. Na osnovu analize DNK profila, dobijenih primenom dve
pomenute metode, dokazano je postojanje tri (GTG5-PCR), odnosno četiri (BOX-, ERIC- i M13-
PCR) genetički različite grupe izolata. Dobijeni rezultati su ukazali na postojanje genetičkog
diverziteta i kod novijih populacija bakterije Psa poreklom sa šećerne repe. Daljom analizom
sekvenci više genskih lokusa (MLSA) moguće je detaljnije utvrditi eventualno postojanje
novih populacija ove bakterije u Srbiji.
PB  - Društvo za zaštitu bilja
C3  - XVII simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor, 2023 27-30. novembar, Zbornik rezimea radova
T1  - Novija proučavanja uzročnika bakteriozne pegavosti lista šećerne repe
SP  - 49
ER  - 
@conference{
author = "Popović Milovanović, Tatjana and Trkulja, Nenad and Ristić, Danijela and Iličić, Renata and Trkulja, Vojislav and Jelušić, Aleksandra",
year = "2023",
abstract = "Bakteriozna pegavost lista šećerne repe prouzrokovana fitopatogenom bakterijom
Pseudomonas syringae pv. aptata (Psa) je široko rasprostranjena bolest, koja osim ove biljne
kulture napada blitvu, cveklu i dr. Ova bolest se poslednjih godina sve češće javlja na usevima
šećerne repe u Srbiji, posebno u uslovima prohladnog i vlažnog proleća. Epifitocije su
beležene 2013. godine u centralnim i južnim delovima Vojvodine (Bačka i Srem), kada su na
osnovu sekvenciranja konzervativnog gena gyrB, utvrđene četiri različite alelske varijante
ovog patogena. Obzirom na noviju epifitociju bakteriozne pegavosti lista na području gajenja
šećerne repe u Srbiji, cilj ovoga rada je bio da se izvrši izolacija i identifikacija prouzrokovača i
determiniše njegov genetički diverzitet na osnovu analize ponavljajućih palindromskih
sekvenci (rep-PCR) i nasumično amplifikovanih polimorfnih DNK (RAPD-PCR).
Tokom 2023. godine na šećernoj repi (sorta Viola) u lokalitetima Ruski Krstur i Srpski
Miletić prikupljeni su uzorci obolelog lišća sa simptomima bakteriozne pegavosti u vidu
nepravilnih nekrotičnih pega, oivičenih tamnijim marginama, sa centralnim delom mrke do
sive boje. U nekim slučajevima pege su se spajale čineći veću nekrotičnu leziju. Izolacija je
vršena na hranljivu podlogu obogaćenu sa 5% saharoze (NAS), na kojoj su nakon tri dana
inkubacije na 26 °C, dominirale beličaste, okrugle, sjajne i ispupčene bakterijske kolonije. Za
dalji rad je odabrano 18 izolata, a kao uporedni poslužili su referentni Psa sojevi, PD193 i
PD197. Prema rezultatima LOPAT testova, svi izolati su pokazali pripadnost Ia grupi
fluorescentnih Pseudomonas (+---+). Patogenost je dokazana infiltracijom bakterijske
suspenzije u list šećerne repe. Pripadnost izolata bakteriji Psa dokazana je PCR metodom
primenom prajmera specifičnih za patovar Papt2F/1R kojima su amplifikovani fragmenti DNK
veličine 250 bp karakteristični za Psa. Rep-PCR je izvođen primenom prajmera BOXA1R (BOXPCR), ERIC1R/ERIC2 (ERIC-PCR) i GTG5 (GTG5-PCR), dok je RAPD-PCR rađen primenom
prajmera M13 za M13-PCR. Na osnovu analize DNK profila, dobijenih primenom dve
pomenute metode, dokazano je postojanje tri (GTG5-PCR), odnosno četiri (BOX-, ERIC- i M13-
PCR) genetički različite grupe izolata. Dobijeni rezultati su ukazali na postojanje genetičkog
diverziteta i kod novijih populacija bakterije Psa poreklom sa šećerne repe. Daljom analizom
sekvenci više genskih lokusa (MLSA) moguće je detaljnije utvrditi eventualno postojanje
novih populacija ove bakterije u Srbiji.",
publisher = "Društvo za zaštitu bilja",
journal = "XVII simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor, 2023 27-30. novembar, Zbornik rezimea radova",
title = "Novija proučavanja uzročnika bakteriozne pegavosti lista šećerne repe",
pages = "49"
}
Popović Milovanović, T., Trkulja, N., Ristić, D., Iličić, R., Trkulja, V.,& Jelušić, A.. (2023). Novija proučavanja uzročnika bakteriozne pegavosti lista šećerne repe. in XVII simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor, 2023 27-30. novembar, Zbornik rezimea radova
Društvo za zaštitu bilja., 49.
Popović Milovanović T, Trkulja N, Ristić D, Iličić R, Trkulja V, Jelušić A. Novija proučavanja uzročnika bakteriozne pegavosti lista šećerne repe. in XVII simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor, 2023 27-30. novembar, Zbornik rezimea radova. 2023;:49..
Popović Milovanović, Tatjana, Trkulja, Nenad, Ristić, Danijela, Iličić, Renata, Trkulja, Vojislav, Jelušić, Aleksandra, "Novija proučavanja uzročnika bakteriozne pegavosti lista šećerne repe" in XVII simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor, 2023 27-30. novembar, Zbornik rezimea radova (2023):49.

Phylogeographic Analysis of Soft-Rot-Causing Pectobacterium spp. Strains Obtained from Cabbage in Serbia

Jelušić, Aleksandra; Scortichini, Marco; Marković, Sanja; Mitrović, Petar; Iličić, Renata; Stanković, Slaviša; Popović Milovanović, Tatjana

(MDPI, 2023)

TY  - JOUR
AU  - Jelušić, Aleksandra
AU  - Scortichini, Marco
AU  - Marković, Sanja
AU  - Mitrović, Petar
AU  - Iličić, Renata
AU  - Stanković, Slaviša
AU  - Popović Milovanović, Tatjana
PY  - 2023
UR  - https://plantarum.izbis.bg.ac.rs/handle/123456789/1138
AB  - The aim of this study was to establish a link between genetic diversity and the geographic origin of Pectobacterium strains belonging to three species—P. carotovorum, P. versatile, and P. odoriferum—isolated from cabbage in Serbia by comparing their sequences with those of strains sourced from different hosts and countries in Europe, Asia, and North America. Phylogeographic relatedness was reconstructed using the Templeton, Crandall, and Sing’s (TCS) haplotype network based on concatenated sequences of the housekeeping genes dnaX, icdA, mdh, and proA, while pairwise genetic distances were computed by applying the p-distance model. The obtained TCS haplotype networks indicated the existence of high intra-species genetic diversity among strains of all three species, as reflected in the 0.2–2.3%, 0.2–2.5%, and 0.1–1.7% genetic distance ranges obtained for P. carotovorum, P. versatile, and P. odoriferum, respectively. Five new haplotypes (denoted as HPc1–HPc5) were detected among cabbage strains of P. carotovorum, while one new haplotype was identified for both P. versatile (HPv1) and P. odoriferum (HPo1). None of the TCS haplotype networks provided evidence of significant correlation between geographic origin and the determined haplotypes, i.e., the infection origin. However, as haplotype network results are affected by the availability of sequencing data in public databases for the used genes and the number of analyzed strains, these findings may also be influenced by small sample size.
PB  - MDPI
T2  - Microorganisms
T1  - Phylogeographic Analysis of Soft-Rot-Causing Pectobacterium spp. Strains Obtained from Cabbage in Serbia
IS  - 8
IS  - 2122
VL  - 11
DO  - 10.3390/microorganisms11082122
ER  - 
@article{
author = "Jelušić, Aleksandra and Scortichini, Marco and Marković, Sanja and Mitrović, Petar and Iličić, Renata and Stanković, Slaviša and Popović Milovanović, Tatjana",
year = "2023",
abstract = "The aim of this study was to establish a link between genetic diversity and the geographic origin of Pectobacterium strains belonging to three species—P. carotovorum, P. versatile, and P. odoriferum—isolated from cabbage in Serbia by comparing their sequences with those of strains sourced from different hosts and countries in Europe, Asia, and North America. Phylogeographic relatedness was reconstructed using the Templeton, Crandall, and Sing’s (TCS) haplotype network based on concatenated sequences of the housekeeping genes dnaX, icdA, mdh, and proA, while pairwise genetic distances were computed by applying the p-distance model. The obtained TCS haplotype networks indicated the existence of high intra-species genetic diversity among strains of all three species, as reflected in the 0.2–2.3%, 0.2–2.5%, and 0.1–1.7% genetic distance ranges obtained for P. carotovorum, P. versatile, and P. odoriferum, respectively. Five new haplotypes (denoted as HPc1–HPc5) were detected among cabbage strains of P. carotovorum, while one new haplotype was identified for both P. versatile (HPv1) and P. odoriferum (HPo1). None of the TCS haplotype networks provided evidence of significant correlation between geographic origin and the determined haplotypes, i.e., the infection origin. However, as haplotype network results are affected by the availability of sequencing data in public databases for the used genes and the number of analyzed strains, these findings may also be influenced by small sample size.",
publisher = "MDPI",
journal = "Microorganisms",
title = "Phylogeographic Analysis of Soft-Rot-Causing Pectobacterium spp. Strains Obtained from Cabbage in Serbia",
number = "8, 2122",
volume = "11",
doi = "10.3390/microorganisms11082122"
}
Jelušić, A., Scortichini, M., Marković, S., Mitrović, P., Iličić, R., Stanković, S.,& Popović Milovanović, T.. (2023). Phylogeographic Analysis of Soft-Rot-Causing Pectobacterium spp. Strains Obtained from Cabbage in Serbia. in Microorganisms
MDPI., 11(8).
https://doi.org/10.3390/microorganisms11082122
Jelušić A, Scortichini M, Marković S, Mitrović P, Iličić R, Stanković S, Popović Milovanović T. Phylogeographic Analysis of Soft-Rot-Causing Pectobacterium spp. Strains Obtained from Cabbage in Serbia. in Microorganisms. 2023;11(8).
doi:10.3390/microorganisms11082122 .
Jelušić, Aleksandra, Scortichini, Marco, Marković, Sanja, Mitrović, Petar, Iličić, Renata, Stanković, Slaviša, Popović Milovanović, Tatjana, "Phylogeographic Analysis of Soft-Rot-Causing Pectobacterium spp. Strains Obtained from Cabbage in Serbia" in Microorganisms, 11, no. 8 (2023),
https://doi.org/10.3390/microorganisms11082122 . .

An Overview of the Emergence of Plant Pathogen ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ in Europe

Trkulja, Vojislav; Tomić, Andrija; Matić, Slavica; Trkulja, Nenad; Iličić, Renata; Popović Milovanović, Tatjana

(MDPI, 2023)

TY  - JOUR
AU  - Trkulja, Vojislav
AU  - Tomić, Andrija
AU  - Matić, Slavica
AU  - Trkulja, Nenad
AU  - Iličić, Renata
AU  - Popović Milovanović, Tatjana
PY  - 2023
UR  - https://plantarum.izbis.bg.ac.rs/handle/123456789/857
AB  - In this paper, a comprehensive overview of the ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ presence in Europe was provided. The analyzed findings revealed that, since the first appearance of this pathogen in Finland and Spain in 2008, it has spread to 13 new European countries. Therefore, ‘Ca. L. solanacearum’ has spread very quickly across the European continent, as evident from the emergence of new host plants within the Apiaceae, Urticaceae, and Polygonaceae families, as well as new haplotypes of this pathogen. Thus far, 5 of the 15 ‘Ca. L. solanacearum’ haplotypes determined across the globe have been confirmed in Europe (haplotypes C, D, E, U, and H). Fully competent ‘Ca. L. solanacearum’ vectors include Bactericera cockerelli, Trioza apicalis, and B. trigonica; however, only T. apicalis and B. trigonica are presently established in Europe and are very important for plants from the Apiaceae family in particular. Moreover, psyllid species such as B. tremblayi, T. urticae, and T. anthrisci have also been confirmed positive for ‘Ca. L. solanacearum’. Constant monitoring of its spread in the field (in both symptomatic and asymptomatic plants), use of sensitive molecular diagnostic techniques, and application of timely management strategies are, therefore, of utmost importance for the control of this destructive pathogen.
PB  - MDPI
T2  - Microorganisms
T1  - An Overview of the Emergence of Plant Pathogen ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ in Europe
SP  - 1699
VL  - 11
DO  - 10.3390/microorganisms11071699
ER  - 
@article{
author = "Trkulja, Vojislav and Tomić, Andrija and Matić, Slavica and Trkulja, Nenad and Iličić, Renata and Popović Milovanović, Tatjana",
year = "2023",
abstract = "In this paper, a comprehensive overview of the ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ presence in Europe was provided. The analyzed findings revealed that, since the first appearance of this pathogen in Finland and Spain in 2008, it has spread to 13 new European countries. Therefore, ‘Ca. L. solanacearum’ has spread very quickly across the European continent, as evident from the emergence of new host plants within the Apiaceae, Urticaceae, and Polygonaceae families, as well as new haplotypes of this pathogen. Thus far, 5 of the 15 ‘Ca. L. solanacearum’ haplotypes determined across the globe have been confirmed in Europe (haplotypes C, D, E, U, and H). Fully competent ‘Ca. L. solanacearum’ vectors include Bactericera cockerelli, Trioza apicalis, and B. trigonica; however, only T. apicalis and B. trigonica are presently established in Europe and are very important for plants from the Apiaceae family in particular. Moreover, psyllid species such as B. tremblayi, T. urticae, and T. anthrisci have also been confirmed positive for ‘Ca. L. solanacearum’. Constant monitoring of its spread in the field (in both symptomatic and asymptomatic plants), use of sensitive molecular diagnostic techniques, and application of timely management strategies are, therefore, of utmost importance for the control of this destructive pathogen.",
publisher = "MDPI",
journal = "Microorganisms",
title = "An Overview of the Emergence of Plant Pathogen ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ in Europe",
pages = "1699",
volume = "11",
doi = "10.3390/microorganisms11071699"
}
Trkulja, V., Tomić, A., Matić, S., Trkulja, N., Iličić, R.,& Popović Milovanović, T.. (2023). An Overview of the Emergence of Plant Pathogen ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ in Europe. in Microorganisms
MDPI., 11, 1699.
https://doi.org/10.3390/microorganisms11071699
Trkulja V, Tomić A, Matić S, Trkulja N, Iličić R, Popović Milovanović T. An Overview of the Emergence of Plant Pathogen ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ in Europe. in Microorganisms. 2023;11:1699.
doi:10.3390/microorganisms11071699 .
Trkulja, Vojislav, Tomić, Andrija, Matić, Slavica, Trkulja, Nenad, Iličić, Renata, Popović Milovanović, Tatjana, "An Overview of the Emergence of Plant Pathogen ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’ in Europe" in Microorganisms, 11 (2023):1699,
https://doi.org/10.3390/microorganisms11071699 . .
1

Molekularna karakterizacija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum poreklom sa trešnje i šljive u Srbiji

Jelušić, Aleksandra; Popović Milovanović, Tatjana; Marković, Sanja; Blagojević, Milan; Bagi, Ferenc; Iličić, Renata

(Društvo za zaštitu bilja, 2021)

TY  - CONF
AU  - Jelušić, Aleksandra
AU  - Popović Milovanović, Tatjana
AU  - Marković, Sanja
AU  - Blagojević, Milan
AU  - Bagi, Ferenc
AU  - Iličić, Renata
PY  - 2021
UR  - https://plantarum.izbis.bg.ac.rs/handle/123456789/821
AB  - Bakterija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, prouzrokovač bakteriozne pegavosti listova i plodova, ekonomski je značajan patogen koštičavih vrsta voćaka. Pri povoljim vremenskim uslovima za razvoj (kišovito i prohladno vreme) bolest se brzo širi zahvatajući masovno listove cele krune stabla. Pored pegavosti, P. s. pv. morsprunorum prouzrokuje simptome uvelosti, sušenja i rak rane drvenastih delova biljnih domaćina. Cilj ovog rada je da se genetički okarakterišu sojevi P. syringae pv. morsprunorum poreklom sa obolelih listova trešnje i šljive. U radu su korišćeni sojevi poreklom sa trešnje (lokalitet Topola, 2016. godina) i šljive (lokalitet Krušedol selo, 2020. godina). Genetička karakterizacija je vršena metodom analize multilokusnih sekvenci (MLSA), dobijenih korišćenjem 4 konzervisana gena: gapA, gltA, gyrB i rpoD. DNK sojeva je izolovana CTAB metodom, a amplifikacija je vršena metodom lančane reakcije polimeraze (PCR) prema sledećem programu: početna denaturacija na 94 °C u trajanju od 3 minuta, zatim 30 ciklusa denaturacije na 94 °C 2 minuta, hibridizacije na 54 °C (gapA), 56 °C (gltA), 62 °C (gyrB) ili 63 °C (rpoD) 1 minut i elongacije na 72 °C 1 minut, i finalna elongacija na 72 °C u trajanju od 10 minuta. PCR produkti su sekvencirani i dobijene sekvence su korišćene za konstruisanje filogenetskih stabala (MegaX program) na osnovu pojedinačnih i konkatamernih sekvenci. Za filogenetsku analizu su pored sojeva poreklom sa trešnje i šljive iz Srbije korišćeni i referentni sojevi vrsta prouzrokovača bakteriozne pegavosti koštičavog voća deponovani u NCBI bazi (P. s. pv. morsprunorum rase 1 i 2, P. s. pv. syringae, P. s. pv. avii, P. s. pv. persicae i P. cerasi). PCR amplifikacija je rezultirala produktima veličine 634 bp (gapA), 556 bp (gltA), 610 bp (gyrB) i 521 bp (rpoD) kod svih analiziranih sojeva. Sekvence su sređene i poravnate na veličine od 610 nt (gapA), 526 nt (gltA), 569 nt (gyrB) i 483 nt (rpoD). Na osnovu pojedinačnih gena sojevi sa trešnje i šljive iz Srbije su grupisani u jedan klaster na filogenetskom stablu, što ukazuje na njihovu genetičku homogenost. Zbirno filogenetsko stablo konstruisano na osnovu konkatamernih sekvenci sva četiri gena (2188 nt) grupisalo je sojeve sa trešnje i šljive zajedno sa P. s. pv. morsprunorum rasom 1 poreklom sa šljive iz Poljske i P. amygdali pv. morsprunorum poreklom sa trešnje iz Velike Britanije i Srbije izolovanim 2012. godine. Referentni sojevi ostalih Pseudomonas vrsta korišćenih za filogenetsku analizu jasno su odvojeni u posebne klastere. Na osnovu dobijenih rezultata može se zaključiti da su sojevi P. s. pv. morsprunorum rasa 1 poreklom iz Srbije genetički homogeni bez obzira na godinu, domaćina ili lokalitet sa kog su izolovani.
PB  - Društvo za zaštitu bilja
C3  - XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021: 34-35
T1  - Molekularna karakterizacija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum poreklom sa trešnje i šljive u Srbiji
ER  - 
@conference{
author = "Jelušić, Aleksandra and Popović Milovanović, Tatjana and Marković, Sanja and Blagojević, Milan and Bagi, Ferenc and Iličić, Renata",
year = "2021",
abstract = "Bakterija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum, prouzrokovač bakteriozne pegavosti listova i plodova, ekonomski je značajan patogen koštičavih vrsta voćaka. Pri povoljim vremenskim uslovima za razvoj (kišovito i prohladno vreme) bolest se brzo širi zahvatajući masovno listove cele krune stabla. Pored pegavosti, P. s. pv. morsprunorum prouzrokuje simptome uvelosti, sušenja i rak rane drvenastih delova biljnih domaćina. Cilj ovog rada je da se genetički okarakterišu sojevi P. syringae pv. morsprunorum poreklom sa obolelih listova trešnje i šljive. U radu su korišćeni sojevi poreklom sa trešnje (lokalitet Topola, 2016. godina) i šljive (lokalitet Krušedol selo, 2020. godina). Genetička karakterizacija je vršena metodom analize multilokusnih sekvenci (MLSA), dobijenih korišćenjem 4 konzervisana gena: gapA, gltA, gyrB i rpoD. DNK sojeva je izolovana CTAB metodom, a amplifikacija je vršena metodom lančane reakcije polimeraze (PCR) prema sledećem programu: početna denaturacija na 94 °C u trajanju od 3 minuta, zatim 30 ciklusa denaturacije na 94 °C 2 minuta, hibridizacije na 54 °C (gapA), 56 °C (gltA), 62 °C (gyrB) ili 63 °C (rpoD) 1 minut i elongacije na 72 °C 1 minut, i finalna elongacija na 72 °C u trajanju od 10 minuta. PCR produkti su sekvencirani i dobijene sekvence su korišćene za konstruisanje filogenetskih stabala (MegaX program) na osnovu pojedinačnih i konkatamernih sekvenci. Za filogenetsku analizu su pored sojeva poreklom sa trešnje i šljive iz Srbije korišćeni i referentni sojevi vrsta prouzrokovača bakteriozne pegavosti koštičavog voća deponovani u NCBI bazi (P. s. pv. morsprunorum rase 1 i 2, P. s. pv. syringae, P. s. pv. avii, P. s. pv. persicae i P. cerasi). PCR amplifikacija je rezultirala produktima veličine 634 bp (gapA), 556 bp (gltA), 610 bp (gyrB) i 521 bp (rpoD) kod svih analiziranih sojeva. Sekvence su sređene i poravnate na veličine od 610 nt (gapA), 526 nt (gltA), 569 nt (gyrB) i 483 nt (rpoD). Na osnovu pojedinačnih gena sojevi sa trešnje i šljive iz Srbije su grupisani u jedan klaster na filogenetskom stablu, što ukazuje na njihovu genetičku homogenost. Zbirno filogenetsko stablo konstruisano na osnovu konkatamernih sekvenci sva četiri gena (2188 nt) grupisalo je sojeve sa trešnje i šljive zajedno sa P. s. pv. morsprunorum rasom 1 poreklom sa šljive iz Poljske i P. amygdali pv. morsprunorum poreklom sa trešnje iz Velike Britanije i Srbije izolovanim 2012. godine. Referentni sojevi ostalih Pseudomonas vrsta korišćenih za filogenetsku analizu jasno su odvojeni u posebne klastere. Na osnovu dobijenih rezultata može se zaključiti da su sojevi P. s. pv. morsprunorum rasa 1 poreklom iz Srbije genetički homogeni bez obzira na godinu, domaćina ili lokalitet sa kog su izolovani.",
publisher = "Društvo za zaštitu bilja",
journal = "XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021: 34-35",
title = "Molekularna karakterizacija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum poreklom sa trešnje i šljive u Srbiji"
}
Jelušić, A., Popović Milovanović, T., Marković, S., Blagojević, M., Bagi, F.,& Iličić, R.. (2021). Molekularna karakterizacija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum poreklom sa trešnje i šljive u Srbiji. in XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021: 34-35
Društvo za zaštitu bilja..
Jelušić A, Popović Milovanović T, Marković S, Blagojević M, Bagi F, Iličić R. Molekularna karakterizacija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum poreklom sa trešnje i šljive u Srbiji. in XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021: 34-35. 2021;..
Jelušić, Aleksandra, Popović Milovanović, Tatjana, Marković, Sanja, Blagojević, Milan, Bagi, Ferenc, Iličić, Renata, "Molekularna karakterizacija Pseudomonas syringae pv. morsprunorum poreklom sa trešnje i šljive u Srbiji" in XVI simpozijum o zaštiti bilja, Zlatibor 22. do 25. novembra 2021: 34-35 (2021).

Characterization of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum isolates from a recent outbreak on cabbage in Bosnia and Herzegovina

Popović Milovanović, Tatjana; Jelušić, Aleksandra; Marković, Sanja; Iličić, Renata

(Institute of Pesticides and Environmental Protection, Belgrade & Plant Protection Society of Serbia, Belgrade, 2019)

TY  - JOUR
AU  - Popović Milovanović, Tatjana
AU  - Jelušić, Aleksandra
AU  - Marković, Sanja
AU  - Iličić, Renata
PY  - 2019
UR  - https://plantarum.izbis.bg.ac.rs/handle/123456789/913
AB  - The causal agent of soft rot disease associated with a cabbage outbreak in Semberija region, Bosnia and Herzegovina, in 2018 was identified and characterized. Symptoms appeared in the form of water-soaked lesions on leaves and specific odour. Disease incidence ranged from 20% to 30%. The causal pathogen was isolated on nutrient agar (NA), King’s B and crystal violet pectate (CVP) media. Eight creamy-white, round and convex bacterial isolates, which produced characteristic pits on CVP medium were taken as representative. They were gram negative, facultative anaerobe, oxidase negative, catalase positive, nonfluorescent on King’s B medium, levan and arginine dehydrolase negative. The isolates were able to cause soft rot on cabbage and potato tuber slices 24 h after inoculation under conditions of high relative humidity. Polymerase chain reaction (PCR) was performed for preliminary identification by using three specific primer sets: F0145/E2477 (specific for Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum), Br1f/L1r (specific for P. carotovorum subsp. brasiliensis) and ECA1f/ECA2r (specific for P. atrosepticum). All isolates produced the band size of 666 bp with F0145/E2477 primer pair, indicating that they belong to the species P. carotovorum subsp. carotovorum. Further genetic characterization was based on sequence analysis of the gapA and mdh housekeeping genes. BLAST analysis confirmed 99.39% (Q. cover 100%, E. value 0.0) and 100% (Q. cover 100%, E. value 0.0) identity of the isolates with P. carotovorum subsp. carotovorum strains deposited in the NCBI database as M34 (KY047594) for gapA and Pcc t0437 (KC337296) for mdh genes, respectively. Phylogenetic analysis showed genetic homogeneity among the cabbage isolates.
PB  - Institute of Pesticides and Environmental Protection, Belgrade & Plant Protection Society of Serbia, Belgrade
T2  - Pesticidi i fitomedicina
T1  - Characterization of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum isolates from a recent outbreak on cabbage in Bosnia and Herzegovina
EP  - 222
IS  - 3-4
SP  - 211
VL  - 34
DO  - 10.2298/pif1904211p
DO  - 1820-3949
ER  - 
@article{
author = "Popović Milovanović, Tatjana and Jelušić, Aleksandra and Marković, Sanja and Iličić, Renata",
year = "2019",
abstract = "The causal agent of soft rot disease associated with a cabbage outbreak in Semberija region, Bosnia and Herzegovina, in 2018 was identified and characterized. Symptoms appeared in the form of water-soaked lesions on leaves and specific odour. Disease incidence ranged from 20% to 30%. The causal pathogen was isolated on nutrient agar (NA), King’s B and crystal violet pectate (CVP) media. Eight creamy-white, round and convex bacterial isolates, which produced characteristic pits on CVP medium were taken as representative. They were gram negative, facultative anaerobe, oxidase negative, catalase positive, nonfluorescent on King’s B medium, levan and arginine dehydrolase negative. The isolates were able to cause soft rot on cabbage and potato tuber slices 24 h after inoculation under conditions of high relative humidity. Polymerase chain reaction (PCR) was performed for preliminary identification by using three specific primer sets: F0145/E2477 (specific for Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum), Br1f/L1r (specific for P. carotovorum subsp. brasiliensis) and ECA1f/ECA2r (specific for P. atrosepticum). All isolates produced the band size of 666 bp with F0145/E2477 primer pair, indicating that they belong to the species P. carotovorum subsp. carotovorum. Further genetic characterization was based on sequence analysis of the gapA and mdh housekeeping genes. BLAST analysis confirmed 99.39% (Q. cover 100%, E. value 0.0) and 100% (Q. cover 100%, E. value 0.0) identity of the isolates with P. carotovorum subsp. carotovorum strains deposited in the NCBI database as M34 (KY047594) for gapA and Pcc t0437 (KC337296) for mdh genes, respectively. Phylogenetic analysis showed genetic homogeneity among the cabbage isolates.",
publisher = "Institute of Pesticides and Environmental Protection, Belgrade & Plant Protection Society of Serbia, Belgrade",
journal = "Pesticidi i fitomedicina",
title = "Characterization of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum isolates from a recent outbreak on cabbage in Bosnia and Herzegovina",
pages = "222-211",
number = "3-4",
volume = "34",
doi = "10.2298/pif1904211p, 1820-3949"
}
Popović Milovanović, T., Jelušić, A., Marković, S.,& Iličić, R.. (2019). Characterization of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum isolates from a recent outbreak on cabbage in Bosnia and Herzegovina. in Pesticidi i fitomedicina
Institute of Pesticides and Environmental Protection, Belgrade & Plant Protection Society of Serbia, Belgrade., 34(3-4), 211-222.
https://doi.org/10.2298/pif1904211p
Popović Milovanović T, Jelušić A, Marković S, Iličić R. Characterization of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum isolates from a recent outbreak on cabbage in Bosnia and Herzegovina. in Pesticidi i fitomedicina. 2019;34(3-4):211-222.
doi:10.2298/pif1904211p .
Popović Milovanović, Tatjana, Jelušić, Aleksandra, Marković, Sanja, Iličić, Renata, "Characterization of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum isolates from a recent outbreak on cabbage in Bosnia and Herzegovina" in Pesticidi i fitomedicina, 34, no. 3-4 (2019):211-222,
https://doi.org/10.2298/pif1904211p . .
5