Molecular identification of Fusarium graminearum, sorghum pathogen in Serbia
Authors
Ristić, DanijelaVučurović, Ana
Stanković, Ivana
Nikolić, Dušan
Berenji, Janoš
Krstić, Branka
Bulajić, Aleksandra
Article (Published version)
Metadata
Show full item recordAbstract
U periodu 2009-2011. na lokalitetima u Bačkom Petrovcu i Čantaviru prikupljeno je i analizirano 39 uzoraka biljaka gajenog sirka (Sorghum bicolor) sa simptomima truleži prizemnog dela stabla. Iz biljnog tkiva izolovane su monosporne kulture, čija je patogenost potvrđena pojavom simptoma na veštački inokulisanim biljkama sirka, a na osnovu morfoloških makroskopskih i mikroskopskih osobina identifikovan je Fusarium graminearum. Molekularna identifikacija obavljena je primenom lančane reakcije polimeraze (PCR, Polymerase Chain Reaction) uz korišćenje prajmera ef1/ef2 i amplifikaciju kodirajućeg proteinskog gena TEF 1-alfa. Sekvenca TEF gena odabranog izolata 535-10 (JF747146) je pokazala 98% do 99% nukleotidne identičnosti sa sekvencama 63 izolata Gibberella zeae deponovanih u NCBI bazi podataka. Amplifikacijom barkoding dela genoma F. graminearum izolata iz sirka dat je doprinos bržoj i preciznijoj identifikaciji i karakterizaciji vrsta roda Fusarium u Srbiji.
Keywords:
molekularna identifikacija / morfološke osobine / sirak / TEF gen / testovi patogenostiSource:
Ratarstvo i povrtarstvo, 2011, 48, 2, 347-352Publisher:
- Institut za ratarstvo i povrtarstvo, Novi Sad
Funding / projects:
- Improvement of Maize and Sorghum Production Under Stress Conditions (RS-MESTD-Technological Development (TD or TR)-31073)
- Agrobiodiversity and land-use change in Serbia: an integrated biodiversity assessment of key functional groups of arthropods and plant pathogens (RS-MESTD-Integrated and Interdisciplinary Research (IIR or III)-43001)
Collections
Institution/Community
IZBISTY - JOUR AU - Ristić, Danijela AU - Vučurović, Ana AU - Stanković, Ivana AU - Nikolić, Dušan AU - Berenji, Janoš AU - Krstić, Branka AU - Bulajić, Aleksandra PY - 2011 UR - https://plantarum.izbis.bg.ac.rs/handle/123456789/1086 AB - U periodu 2009-2011. na lokalitetima u Bačkom Petrovcu i Čantaviru prikupljeno je i analizirano 39 uzoraka biljaka gajenog sirka (Sorghum bicolor) sa simptomima truleži prizemnog dela stabla. Iz biljnog tkiva izolovane su monosporne kulture, čija je patogenost potvrđena pojavom simptoma na veštački inokulisanim biljkama sirka, a na osnovu morfoloških makroskopskih i mikroskopskih osobina identifikovan je Fusarium graminearum. Molekularna identifikacija obavljena je primenom lančane reakcije polimeraze (PCR, Polymerase Chain Reaction) uz korišćenje prajmera ef1/ef2 i amplifikaciju kodirajućeg proteinskog gena TEF 1-alfa. Sekvenca TEF gena odabranog izolata 535-10 (JF747146) je pokazala 98% do 99% nukleotidne identičnosti sa sekvencama 63 izolata Gibberella zeae deponovanih u NCBI bazi podataka. Amplifikacijom barkoding dela genoma F. graminearum izolata iz sirka dat je doprinos bržoj i preciznijoj identifikaciji i karakterizaciji vrsta roda Fusarium u Srbiji. PB - Institut za ratarstvo i povrtarstvo, Novi Sad T2 - Ratarstvo i povrtarstvo T1 - Molecular identification of Fusarium graminearum, sorghum pathogen in Serbia EP - 352 IS - 2 SP - 347 VL - 48 DO - 10.5937/ratpov1102347R ER -
@article{ author = "Ristić, Danijela and Vučurović, Ana and Stanković, Ivana and Nikolić, Dušan and Berenji, Janoš and Krstić, Branka and Bulajić, Aleksandra", year = "2011", abstract = "U periodu 2009-2011. na lokalitetima u Bačkom Petrovcu i Čantaviru prikupljeno je i analizirano 39 uzoraka biljaka gajenog sirka (Sorghum bicolor) sa simptomima truleži prizemnog dela stabla. Iz biljnog tkiva izolovane su monosporne kulture, čija je patogenost potvrđena pojavom simptoma na veštački inokulisanim biljkama sirka, a na osnovu morfoloških makroskopskih i mikroskopskih osobina identifikovan je Fusarium graminearum. Molekularna identifikacija obavljena je primenom lančane reakcije polimeraze (PCR, Polymerase Chain Reaction) uz korišćenje prajmera ef1/ef2 i amplifikaciju kodirajućeg proteinskog gena TEF 1-alfa. Sekvenca TEF gena odabranog izolata 535-10 (JF747146) je pokazala 98% do 99% nukleotidne identičnosti sa sekvencama 63 izolata Gibberella zeae deponovanih u NCBI bazi podataka. Amplifikacijom barkoding dela genoma F. graminearum izolata iz sirka dat je doprinos bržoj i preciznijoj identifikaciji i karakterizaciji vrsta roda Fusarium u Srbiji.", publisher = "Institut za ratarstvo i povrtarstvo, Novi Sad", journal = "Ratarstvo i povrtarstvo", title = "Molecular identification of Fusarium graminearum, sorghum pathogen in Serbia", pages = "352-347", number = "2", volume = "48", doi = "10.5937/ratpov1102347R" }
Ristić, D., Vučurović, A., Stanković, I., Nikolić, D., Berenji, J., Krstić, B.,& Bulajić, A.. (2011). Molecular identification of Fusarium graminearum, sorghum pathogen in Serbia. in Ratarstvo i povrtarstvo Institut za ratarstvo i povrtarstvo, Novi Sad., 48(2), 347-352. https://doi.org/10.5937/ratpov1102347R
Ristić D, Vučurović A, Stanković I, Nikolić D, Berenji J, Krstić B, Bulajić A. Molecular identification of Fusarium graminearum, sorghum pathogen in Serbia. in Ratarstvo i povrtarstvo. 2011;48(2):347-352. doi:10.5937/ratpov1102347R .
Ristić, Danijela, Vučurović, Ana, Stanković, Ivana, Nikolić, Dušan, Berenji, Janoš, Krstić, Branka, Bulajić, Aleksandra, "Molecular identification of Fusarium graminearum, sorghum pathogen in Serbia" in Ratarstvo i povrtarstvo, 48, no. 2 (2011):347-352, https://doi.org/10.5937/ratpov1102347R . .